Respuesta corta: sí, pero necesita obtener permiso (y software modificado) de ONT antes de hacer eso.
... pero eso no cuenta toda la historia. Esta pregunta tiene el potencial de ser muy confusa, y eso no es culpa del interrogador. El problema es que para el MinION, la secuenciación (o más específicamente, la generación de datos sin procesar en forma de un rastro de señal eléctrica) es distinta y separable de la llamada base. Muchos otros secuenciadores también tienen distintos datos en bruto y fases de llamada de bases, pero no están democratizados en la medida en que están en el MinION.
La parte de "secuenciación" de la secuenciación de MinION se lleva a cabo mediante el software ONT , a saber, MinKNOW. Como me explicaron durante PoreCampAU 2017, cuando el MinION se conecta inicialmente a un ordenador, falta el firmware necesario para llevar a cabo la secuenciación. La versión más reciente de este firmware generalmente se descarga al comienzo de una secuencia de ejecución enviando una solicitud a los servidores ONT. En el caso habitual, no puede realizar la secuenciación sin poder acceder a esos servidores, y no puede realizar la secuenciación sin que ONT lo sepa. Sin embargo, ONT reconoce que hay personas que no tendrán acceso a Internet al realizar la secuenciación (por ejemplo, secuenciar el ébola en África o secuenciación metagenómica en el medio del océano) y un correo electrónico a <support@nanoporetech.com> con motivos es probable que resulte en una solución rápida de software al problema de secuenciación local.
Una vez que se adquieren las señales sin procesar, la parte de "llamada de base" de la secuenciación de MinION se puede realizar en cualquier lugar. El llamador base mantenido por la ONT es Albacore, y este obtendrá las primeras actualizaciones del modelo cada vez que se cambie la tecnología de secuenciación (lo que ocurre con frecuencia). Albacore es una basecaller local que se puede obtener de ONT navegando por las páginas de su comunidad (disponible para cualquiera que tenga un MinION); ONT cambió a permitir que las personas solo realizaran llamadas base localmente aproximadamente en abril de 2017, después de establecer que usar servidores AWS era demasiado costoso. El albacora es de código abierto y gratuito como cerveza, pero tiene un acuerdo de licencia restrictivo que limita la distribución (y modificación) del programa. Sin embargo, Albacore no es el único llamador de bases disponible. ONT proporciona una llamada base FOSS llamada nanonet. Está un poco por detrás de Albacore en tecnología, pero ONT ha dicho que todos los cambios útiles de Albacore eventualmente se propagarán a la nanorred. Hay otro llamador de base que no es de ONT que conozco y que usa una red neuronal para el llamado de base: deepnano. Existen otros llamadores de bases, cada uno de ellos a diferentes distancias de la tecnología, y espero que aparezcan más en el futuro a medida que la tecnología se estabilice y los científicos informáticos más resistentes a los cambios entren en acción.
Editar: ONT ha simplemente corrió la cortina de su software de llamada base; todos los repositorios que he visto hasta ahora (excepto Cliveome) se han publicado bajo la Licencia Pública de Mozilla (libre y de código abierto, con algunas condiciones y limitaciones). En ese repositorio de software se incluye Scrappie, que es su versión de prueba / de vanguardia de Albacore.