La principale question à laquelle vous avez répondu vous-même: les bactéries deviennent résistantes en raison de la pression de sélection causée par la suppression efficace par l'antibiotique des bactéries non résistantes d'origine. Les variantes qui résistent à la suppression sont sélectionnées comme conséquence naturelle.
Comment les bactéries résistantes traitent-elles les antibiotiques? Cela dépend des détails de l'antibiotique particulier, et peut-être du type de résistance.
Prenons le cas de la pénicilline et des antibiotiques associés, comme l ' amoxicilline. Ces antibiotiques agissent en inhibant la formation d'une couche de la paroi cellulaire qui est essentielle pour de nombreux types de bactéries. Cela empêche la multiplication des bactéries et contribue à leur destruction. Wikipedia donne quelques détails sur l'action de ces antibiotiques β-lactamines.
La résistance bactérienne à des médicaments comme la pénicilline prend généralement la forme d'une bactérie produisant une enzyme (appelée β-lactamase) qui brise un anneau dans la molécule du médicament, la désactivant et supprimant ainsi son effet sur la synthèse de la paroi cellulaire .
Cette résistance est devenue courante en raison de l’utilisation généralisée de médicaments de type pénicilline et du transfert du gène correspondant entre les espèces de bactéries comme par des plasmides.
Les chercheurs ont réussi dans les années 70 à découvrir et développer une arme auxiliaire dans cette guerre. Il s'agissait de l ' acide clavulanique, qui a une structure en partie similaire aux pénicillines et qui, comme elles, est attaqué par l'enzyme β-lactamase bactérienne. Contrairement aux pénicilines, il forme un lien permanent avec la molécule d'enzyme, désactivant son activité. Cela a conduit à des médicaments actuellement efficaces comme Augmentin qui incluent dans la même pilule à la fois l'amoxicilline et son protecteur, l'acide clavulanique.