ביואינפורמטיקה
2
תשובות
דיוק מערכי הנתונים המקוריים של ה- DNA האנושי ברצף פרויקט הגנום האנושי?
asked 2017-05-16 23:14:21 UTC
4
תשובות
מה ההבדל בין פורמטים של קבצים FASTA, FASTQ ו- SAM?
asked 2017-05-16 23:37:28 UTC
2
תשובות
ההבדל בין BWA-backtrack ו- BWA-MEM
asked 2017-05-16 23:41:23 UTC
5
תשובות
הערת תכונה: RefSeq לעומת Ensembl לעומת Gencode, מה ההבדל?
asked 2017-05-17 00:24:16 UTC
3
תשובות
להמיר קובץ BAM מהפניה אחת לאחרת?
asked 2017-05-17 01:00:43 UTC
2
תשובות
שיטות נורמליזציה עם ספקטרום ה- ERCC של RNA-Seq?
asked 2017-05-17 10:24:25 UTC
4
תשובות
כיצד לחשב RPKM ב- R?
asked 2017-05-17 15:28:32 UTC
1
תשובה
כיצד לחשב גנים חופפים בין שתי גרסאות ביאור הגנום
asked 2017-05-17 16:51:45 UTC
2
תשובות
דגימה אחת לעומת גנוטיפ משותף
asked 2017-05-17 18:02:17 UTC
9
תשובות
כיצד לדמות קריאות NGS, לשלוט על כיסוי רצף?
asked 2017-05-17 21:26:17 UTC
4
תשובות
כיצד לתאם בין שני אותות דמויי ציור מיטה אפס מנופחים?
asked 2017-05-17 21:52:04 UTC
3
תשובות
איך בונים קלדוגרמה של יחסי פנים-מינים?
asked 2017-05-18 00:20:52 UTC
7
תשובות
כיצד להמיר FASTA ל- BED
asked 2017-05-18 05:14:58 UTC
2
תשובות
אשר הצלחה או כישלון של נורמליזציה של RNA-Seq
asked 2017-05-18 05:28:24 UTC
5
תשובות
שפר גנום התייחסות עם נתוני רצף
asked 2017-05-18 08:11:37 UTC
3
תשובות
כיצד לקבוע במהירות מוטציות בקריאה של קובץ סם?
asked 2017-05-18 08:14:29 UTC
7
תשובות
כיצד לגרסא את הקוד ואת הנתונים במהלך הניתוח?
asked 2017-05-18 14:27:51 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל לקרוא לריאנטים מבניים (SVs) מנתוני קריאות קצרות לזווג קצר?
asked 2017-05-18 19:28:48 UTC
3
תשובות
מהי הדרך הטובה ביותר לתת את הדעת על שינוי תוכן GC בזמן בניית עץ פילוגנטי מבוסס נוקלאוטידים?
asked 2017-05-18 23:52:28 UTC
1
תשובה
כיצד לסנן יישור צולבים מקובץ BED?
asked 2017-05-19 10:49:47 UTC
2
תשובות
למזג מאות קבצי BAM קטנים לקובץ BAM יחיד
asked 2017-05-19 10:50:24 UTC
3
תשובות
כיצד ניתן להבחין בין גרף דה ברוין "הקלאסי" לזה המתואר במאמרי NGS?
asked 2017-05-19 15:32:45 UTC
2
תשובות
האם fgsea ו- Broad Institute של מכון שווה ערך?
asked 2017-05-19 17:32:54 UTC
2
תשובות
מדוע ישנם מרכבים הדורשים קמר באורך מוזר לבניית גרפים של דה ברוין?
asked 2017-05-19 23:34:21 UTC
1
תשובה
האם בסיסים קצוצים רכים משמשים לשיחות וריאציות ב- samtools + bcftools?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
2
תשובות
Phyre2 לעומת ITasser, נוצרו דגמים שונים לחלוטין
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
1
תשובה
במה שונים אלגוריתמי השיא הצרים והשיאים הרחבים של MACS2?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
3
תשובות
בהינתן VCF של גנום אנושי, כיצד אוכל להעריך את האיכות מול SNV ידוע?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
2
תשובות
כיצד להתמודד עם הטרוזיגוזיות במהלך ליטוש הרכבת הגנום על סמך קריאות ארוכות?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
1
תשובה
המדינה, המגבלות והשוואות של חנויות גרסאות גדולות
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
3
תשובות
תכנון סכימת מסד נתונים של קבצי NGS במעבדה
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
4
תשובות
כלים להדמיית קריאות אוקספורד ננופור
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
3
תשובות
אותיות רישיות לעומת אותיות קטנות בגנום ההתייחסות
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
1
תשובה
ההשפעות של המרת ביסולפיט לא מלאה על יעילות המיפוי
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
3
תשובות
מהם היתרונות והחסרונות בין שימוש ב- KEGG או Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
1
תשובה
סיווג דגימות על סמך ביטוי של גן סמן
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל לשפר מכלול עם קריאה ארוכה עם גנום שחוזר על עצמו?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
2
תשובות
מה ההבדל בין ENCODE סוג 1, 2 ו- 3 סוגי תאים?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
2
תשובות
גרסה הקוראת לנתונים בסגנון ChIP-seq: samtools mpileup עם פילטרים מינימליים
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
3
תשובות
כיצד לבחור את המסלולים המייצגים ביותר מניתוח העשרת גנים?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
4
תשובות
כיצד ניתן לאמוד את תרומת קו התאים מנתוני RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
1
תשובה
כימות קריאת מיפוי למיקומים מרובים
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
3
תשובות
האם יש מאגר נתונים רב-אומיקס זמין לציבור?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
2
תשובות
מיפוי מחדש של קואורדינטות גנומיות כדי להתחשב באינדלים
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
3
תשובות
יש מוטיבים של DNA ארוכים 6-12bp, ומנסים להשיג ציוני שימור
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
2
תשובות
האם ניתן לבצע רצף של MinION במצב לא מקוון?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל לשפר את התשואה של ריצות רצף של MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
4
תשובות
כיצד אוכל לזהות באופן שיטתי רצפי ברקוד / מתאם לא ידועים בתוך קבוצת דוגמאות?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
2
תשובות
אילו כלים יכולים לזהות RNA כימי (גנים היתוך) מנתוני WGS או RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
2
תשובות
כיצד להעביר הערות GFF בגנום עם כפילויות נרחבות?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
4
תשובות
עבודה עם גנום ישן
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
4
תשובות
האם יש כיול מחדש של ציונים עבור שיחות וריאציות?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
2
תשובות
הורדת גנום התייחסות ל- Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
1
תשובה
כתובות אתרים להורדה יציבות
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
2
תשובות
גרסה מבנית הקוראת לנתוני PacBio בעלי כיסוי נמוך
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
1
תשובה
הכנסת גנוטיפים חסרים מפאנלים נפרדים של גנוטיפ
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
6
תשובות
האם ישנן אלטרנטיבות של RepBase להערות אלמנטים חוזרים בכל הגנום?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
1
תשובה
מה ההבדל בין גרסאות המפרט VCF 4.1 ו -4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
2
תשובות
כיצד לבחור מבנים באיכות גבוהה מבנק הנתונים לחלבונים?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
3
תשובות
אומדן טוהר / זיהום / תערובת גידול
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
5
תשובות
שימוש בקליפות שאינן bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
3
תשובות
כיצד בדיוק מחושבים "אורך יעיל" ב- FPKM?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
2
תשובות
מציאת המיקום ואורך היחידה של רצפים חוזרים תוך כדי קריאה ארוכה
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
3
תשובות
פותרים HMM גנריים בביואינפורמטיקה?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
6
תשובות
האם ישנם מאגרי מידע של תבניות לפורמטים נפוצים של קבצים ביואינפורמטיים?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
2
תשובות
אימות תת-אוכלוסיות מזוהות של תאים ב- scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
1
תשובה
מהם כל קבצי ההתייחסות המיוצרים על ידי אינדקס bwa, והאם הם תלויים בשאלה אם ההפניה מכווצת?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
2
תשובות
מדוע לקבצי BAM שנוצרו על ידי כלים שונים יש גודל קבצים שונה?
asked 2017-06-03 04:38:14 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל להוריד דגימה של קובץ BAM תוך שמירה על שתי הקריאות בזוגות?
asked 2017-06-03 04:44:45 UTC
1
תשובה
מה ההבדל בין samtools, bamtools, picard, sambamba ו- biobambam?
asked 2017-06-03 04:50:11 UTC
1
תשובה
מדוע מרבית המערכים אינם מפיקים את פעולת CIGAR "X"?
asked 2017-06-03 04:58:11 UTC
3
תשובות
מיזוג נתוני רצף לניסויי שבב- seq
asked 2017-06-03 17:42:58 UTC
1
תשובה
מדוע bwa-mem הוא האלגוריתם הסטנדרטי בעת שימוש ב- bwa?
asked 2017-06-03 18:58:27 UTC
3
תשובות
מה ההבדל בין NGS, 2GS, SBS ו- HTS?
asked 2017-06-04 01:57:33 UTC
1
תשובה
מה ההבדל בין איכות המיפוי של SAM לבין ערך ה- E של הפיצוץ?
asked 2017-06-04 04:01:34 UTC
3
תשובות
האם ניצוץ נמצא בשימוש נרחב בביואינפורמטיקה?
asked 2017-06-04 04:10:33 UTC
1
תשובה
איתור וריאציות מבניות עם נתוני MinION
asked 2017-06-04 18:21:05 UTC
4
תשובות
אילו שיטות קיימות לחישוב דמיון פרופיל ביטוי RNA
asked 2017-06-04 18:50:24 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל להאיץ שיחות / תיקון של INDEL בקבצי BAM?
asked 2017-06-05 04:25:12 UTC
4
תשובות
כיצד אוכל להגדיר משנה יעילה קובץ מבוסס קו גדול מאוד?
asked 2017-06-05 17:49:25 UTC
2
תשובות
חבילות R לניתוח נתונים של מסכי CRISPR מאוגדים
asked 2017-06-05 21:36:55 UTC
1
תשובה
מתי צריך להסביר את האזורים הגנומיים המופיעים ברשימה השחורה בניתוח נתוני ChIP-seq?
asked 2017-06-05 22:15:40 UTC
2
תשובות
כיצד להשוות קבוצות המשתמשות בנתוני WGS?
asked 2017-06-05 23:06:35 UTC
5
תשובות
כיצד אוכל לבצע בדיקת אבות / תערובת בקובץ VCF יחיד?
asked 2017-06-06 17:44:58 UTC
6
תשובות
המרת שמות גנים מתבנית בסיס נתונים ציבורית אחת לאחרת
asked 2017-06-06 18:38:20 UTC
2
תשובות
כיצד מיישמים אפשרויות - cluster for - נחש ו - דרמה?
asked 2017-06-06 19:30:00 UTC
1
תשובה
מה הם כמה שיטות עבודה מומלצות לנקוט במהלך ניתוח נתוני מתילציה של EPIC DNA?
asked 2017-06-07 01:58:15 UTC
2
תשובות
קבלת קריאות ממופות באופן ייחודי מיישור BWA mem
asked 2017-06-07 03:23:31 UTC
1
תשובה
מצב חדשני בחיזוי אתרי ייזום תרגום
asked 2017-06-07 04:44:21 UTC
1
תשובה
מה קנה המידה של HOMER metagenes?
asked 2017-06-07 08:39:26 UTC
2
תשובות
בניית מדד הגנום STAR לרצף RNA ננו-פורתי
asked 2017-06-07 09:20:05 UTC
1
תשובה
כיצד יכול HISAT2 / StringTie לדווח על ערכי כיסוי עשרוניים
asked 2017-06-07 11:21:24 UTC
5
תשובות
היכן נמצא מסד נתונים מירנה מעודכן ומה קרה ל- miRBase?
asked 2017-06-07 13:24:32 UTC
3
תשובות
כיצד לחלץ רצף RNA ומעצורי מבנה משני מקובץ PDB
asked 2017-06-07 13:24:36 UTC
2
תשובות
עומק samtools להדפיס את כל העמדות
asked 2017-06-07 13:39:34 UTC
4
תשובות
באיזו גרסת גנום של Ensembl עלי להשתמש ליישור? (למשל toplevel.fa לעומת primary_assembly.fa)
asked 2017-06-07 18:23:52 UTC
1
תשובה
כיצד לקרוא ולפרש קובץ כימות לביטוי גנים?
asked 2017-06-08 07:25:46 UTC
4
תשובות
עיצוב פורמט ביאור
asked 2017-06-08 12:06:30 UTC
4
תשובות
כיצד אוכל לבנות מסלול רשת חלבונים מקובץ כימות לביטוי גנים?
asked 2017-06-08 12:21:27 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל ליצור קובץ שיוך GO משלי (gaf)?
asked 2017-06-08 12:57:22 UTC
2
תשובות
במה להשתמש לעריכת יישור RNA?
asked 2017-06-08 14:00:53 UTC
4
תשובות
כיצד להמיר שמות מינים לשמות נפוצים?
asked 2017-06-08 15:38:43 UTC
1
תשובה
מהן הדרכים לעבד רשימה של גנים המובעים באופן דיפרנציאלי?
asked 2017-06-08 17:07:23 UTC
2
תשובות
האם שיחות משתנה משתנות כשאתה מתקשר מ- CRAM?
asked 2017-06-08 19:54:57 UTC
5
תשובות
איזו תוכנת מציאת מוטיבים זמינה עבור רצפים מרובים ~ 10Kb?
asked 2017-06-09 01:21:19 UTC
1
תשובה
איזו יחידה אני מקבל על ציר y של עלילת פרופיל מטאגן?
asked 2017-06-09 20:08:41 UTC
1
תשובה
האם ניתן לחשב ערכי p לשינויים מקופלים של דגימות RNA-seq משוכפלות בודדות?
asked 2017-06-09 20:37:50 UTC
2
תשובות
מהם השדות הנדרשים בפועל בקבוצת קריאה של SAM / BAM?
asked 2017-06-09 20:51:25 UTC
2
תשובות
יחסים אחודים לעומת לא מפושטים לתמלילים בנתוני RNA-seq
asked 2017-06-09 21:40:08 UTC
2
תשובות
באילו שיטות עלי להשתמש ב- PythonCyc API לשאילתת מטבוליטים במסד הנתונים של BioCyc?
asked 2017-06-09 23:17:58 UTC
1
תשובה
מהי השיטה הטובה ביותר לאמוד עץ פילוגנטי ממערך נתונים גדול של> 1000 לוקוסים ו> 100 מינים
asked 2017-06-10 08:57:27 UTC
2
תשובות
חילוץ כלל מתוצאות nnet
asked 2017-06-10 16:14:30 UTC
2
תשובות
כיצד לזהות מוטציה ולנבא את התוצאה שלה?
asked 2017-06-11 04:27:13 UTC
4
תשובות
מדוע ביו-מוליך?
asked 2017-06-11 06:28:58 UTC
2
תשובות
קבלת מבנה ורצף שקשורים לתעודות זהות
asked 2017-06-11 18:49:45 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל ליצור רשימת גרסאות (כלומר קובץ VCF) באמצעות קריאות אילומינה מגנום אנושי?
asked 2017-06-12 12:49:44 UTC
2
תשובות
כיצד לתקן אלפא, ולא ערכי p עצמם, למטרות הדמיה
asked 2017-06-12 22:06:26 UTC
3
תשובות
כיצד לבצע ניתוח פונקציונלי ברשימת גנים ב- R?
asked 2017-06-12 22:45:52 UTC
4
תשובות
בהינתן גורם שעתוק, אילו גנים הוא מווסת?
asked 2017-06-13 06:38:39 UTC
2
תשובות
כיצד למצוא את הצורה המאוגדת של מבנה אנזים?
asked 2017-06-13 08:03:53 UTC
2
תשובות
קבל את סטטיסטיקות המיפוי של קריאה יחידה מקובץ BAM
asked 2017-06-13 08:48:15 UTC
4
תשובות
אילו שיטות זמינות למצוא ערך ניתוק לגנים שאינם מתבטאים ב- RNA-seq?
asked 2017-06-13 15:23:17 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל להמיר קבצי מעקב של SCF לקבצי ABI?
asked 2017-06-13 16:51:33 UTC
2
תשובות
כיצד נוכל להבחין בין ספירת אפס אמיתית לספירה של אפס נשירה ב- RNA-seq תא בודד?
asked 2017-06-13 18:03:09 UTC
4
תשובות
ממיר בין PDB או mmCIF ו- MMTF
asked 2017-06-13 18:29:05 UTC
1
תשובה
ספר טווחים גנומיים
asked 2017-06-13 18:43:41 UTC
1
תשובה
האם יש לכלול גנים של סמן מיון תאים במהלך אשכולות?
asked 2017-06-13 21:02:47 UTC
1
תשובה
כיצד תג MD MD צריך להתאים למחרוזת CIGAR?
asked 2017-06-13 21:24:28 UTC
1
תשובה
התאמה אישית של קובץ bigWig
asked 2017-06-13 22:07:48 UTC
1
תשובה
האם השדה האופציונלי של SAM NM ניתן לחישוב מוחלט מ- MD ו- CIGAR?
asked 2017-06-14 03:20:23 UTC
3
תשובות
ויזואליזציה של שחבור RNA-Seq שנקרא זמן רב
asked 2017-06-14 08:16:08 UTC
1
תשובה
יישור רצפים ארוכים רבים
asked 2017-06-14 19:22:56 UTC
3
תשובות
מהן הדרכים לעקוב אחר הענפים בניתוח?
asked 2017-06-15 16:13:41 UTC
3
תשובות
קובץ vCf GRCh38 עם מוטציות נפוצות של סרטן
asked 2017-06-15 16:56:52 UTC
3
תשובות
כיצד למצוא ערכות נתונים של GEO באמצעות זיהוי בנק התרופות ו- bioDBnet
asked 2017-06-15 18:09:16 UTC
5
תשובות
כיצד אוכל לחלץ רק הכנסות מקובץ VCF?
asked 2017-06-16 15:53:50 UTC
2
תשובות
חיפוש נתוני ביטוי גנים לפי קו תא
asked 2017-06-16 16:42:57 UTC
5
תשובות
כיצד נוכל למצוא את המרחק בין כל השאריות בקובץ PDB?
asked 2017-06-16 18:56:09 UTC
2
תשובות
כיצד להעריך האם קריאה ארוכה היא רצף משמעותי?
asked 2017-06-19 05:24:15 UTC
2
תשובות
מציאת הומולוגים של רצף חלבונים
asked 2017-06-19 05:50:23 UTC
12
תשובות
גישה אקראית בקובץ FASTQ
asked 2017-06-19 18:15:23 UTC
4
תשובות
שגיאת פיתון בטווח חופף עם אזורים גנומיים
asked 2017-06-21 00:26:57 UTC
1
תשובה
צומת של שני טווחים גנומיים לשמירה על מטא נתונים
asked 2017-06-22 15:17:24 UTC
1
תשובה
מאגר נתונים מלא, חינמי ומלא עבור שמות ושיעורי אנטיביוטיקה?
asked 2017-06-22 23:57:54 UTC
1
תשובה
כיצד למקסם את הניתוח המהיר באמצעות FastqGeneralIterator (Bio.SeqIO.QualityIO)
asked 2017-06-23 04:42:46 UTC
3
תשובות
פורמט PDB: מספר הערה לטקסט חופשי
asked 2017-06-23 20:59:36 UTC
1
תשובה
באיזה קידוד ציון איכות משתמש PacBio?
asked 2017-06-24 01:03:46 UTC
1
תשובה
כיצד להגדיר מסד נתונים שאינו מספר לפיצוץ מרחוק + חיפוש - -
asked 2017-06-24 02:12:05 UTC
3
תשובות
איך כותבים קובץ .gz fastq עם Biopython?
asked 2017-06-24 08:12:53 UTC
3
תשובות
כיצד להשיג קובץ .bed עם קואורדינטות של כל הגנים
asked 2017-06-24 16:19:24 UTC
2
תשובות
איך מייצרים עלילה באורך קריאה לעומת איכות קריאה לנתוני רצף עם קריאה ארוכה (למשל, MinION)?
asked 2017-06-24 23:16:50 UTC
5
תשובות
מהי הדרך הסטנדרטית לעבוד עם גנום התייחסות דיפלואידי? קווצות משלימות?
asked 2017-06-25 04:33:04 UTC
2
תשובות
כיצד למזג קבצי סם יחד עם הוספת קבוצות קריאה
asked 2017-06-26 13:06:52 UTC
2
תשובות
כלי לחיזוי אינטראקציות בתא
asked 2017-06-27 01:06:27 UTC
4
תשובות
כיצד אוכל ליצור סבך צבע מקודד?
asked 2017-06-27 15:17:45 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל לעגון חלבון לחומצת גרעין?
asked 2017-06-27 21:55:20 UTC
4
תשובות
האם יש ממשק API ממשקי מנוחה עבור Gnomad?
asked 2017-06-28 17:54:00 UTC
7
תשובות
דרך מהירה לספור מספר קריאות ומספר בסיסים בקובץ fastq?
asked 2017-06-28 19:50:27 UTC
1
תשובה
בעיות בשימוש ב- biomaRt כדי לאחזר סמלי hgnc ממזהי תמלול של Ensembl
asked 2017-06-28 22:56:42 UTC
1
תשובה
כיצד למצוא מבנה לולאת סיכת ראש בסט גדול של תמלילי RNA ארוכים שאינם מקודדים
asked 2017-06-29 13:42:12 UTC
2
תשובות
האם יש איזושהי דרך להשתמש בביופיתון כדי לכתוב קבצי Swissprot?
asked 2017-06-29 13:58:04 UTC
3
תשובות
כיצד להמיר את הקובץ .vcf (נזקף) בתבנית GT: GP ל- GT: DS?
asked 2017-06-29 20:45:09 UTC
3
תשובות
איגום נתונים בהרכבת metagenome
asked 2017-06-29 21:24:27 UTC
2
תשובות
הפעל את kallisto בצורה איטרטיבית על פני דוגמאות רבות
asked 2017-06-30 02:19:48 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל לקרוא קבצי FCS באמצעות ספריות קוד פתוח?
asked 2017-06-30 15:37:39 UTC
3
תשובות
כלי או שרת אינטרנט לבניית מטריצת PSSM
asked 2017-06-30 18:19:18 UTC
1
תשובה
השגת כותרות טבלת נתונים מ- GEO באמצעות GEOquery
asked 2017-06-30 21:21:57 UTC
3
תשובות
השגת כל רצפי החלבונים עם ארכיטקטורת תחום מסוימת מ- Pfam
asked 2017-07-03 19:25:40 UTC
3
תשובות
בחירת אתרים מ- VCF שיש להם AD AD> 10
asked 2017-07-03 19:41:40 UTC
3
תשובות
חישוב המטען של פפטיד באופן חישובי
asked 2017-07-04 17:53:14 UTC
1
תשובה
כיצד לדמות "שיעור שגיאות בסיס" ב- art_illumina?
asked 2017-07-05 11:55:03 UTC
2
תשובות
כיצד לבודד גנים מגנום שלם לניתוח עץ פילוגנטי?
asked 2017-07-05 19:20:22 UTC
3
תשובות
אילו כלי יישור רצף תומכים ביישור קודונים?
asked 2017-07-05 19:55:12 UTC
2
תשובות
בסיס הידע של אתרי גוף האדם
asked 2017-07-05 20:23:27 UTC
1
תשובה
scanBam מ- Rsamtools אינו מייבא את אחת הקריאות שלי ל- R.
asked 2017-07-07 15:02:32 UTC
1
תשובה
Y כרומוזום מיושר קורא בנתוני scATAC-seq מקו תאים שמקורו בנקבה?
asked 2017-07-07 17:52:14 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל לחשב ביטוי גנים עבור קבוצה של קריאות RNA?
asked 2017-07-08 19:24:13 UTC
3
תשובות
היכן אוכל למצוא בסיס נתונים המכיל מידע על פנוטיפ יחד עם SNP קשורים?
asked 2017-07-09 08:06:16 UTC
3
תשובות
סינון תמליל טריניטי מבוסס על קריאות RNASeq
asked 2017-07-12 13:14:20 UTC
2
תשובות
באילו כלים אוכל להשתמש בצינור ליבה / ליבת חיידקים?
asked 2017-07-14 16:13:43 UTC
2
תשובות
כיצד להמיר GFF3 ל- GTF2
asked 2017-07-14 18:40:47 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל להשוות בין שני קבצי מיטה?
asked 2017-07-17 20:57:39 UTC
2
תשובות
שילוב השימוש ב- workdir וב- optionjobscript בנחש נחש
asked 2017-07-18 20:34:50 UTC
2
תשובות
פתרונות לניהול נתונים במעבדת ביואינפורמטיקה / אומיקה קטנה?
asked 2017-07-21 17:33:07 UTC
3
תשובות
כלי ויזואליזציה לנתוני אינטראקציה לטווח ארוך של 3C / Hi-C?
asked 2017-07-21 23:15:18 UTC
1
תשובה
קבלת רצף חלבון FASTA מבוסס על מילת מפתח עם פיתון
asked 2017-07-25 14:34:44 UTC
2
תשובות
עיצוב מורכב של ביטוי גנים דיפרנציאלי לא משכפל
asked 2017-07-25 22:23:52 UTC
2
תשובות
האם יש פורמט קבצי ספירת k-mer רגיל?
asked 2017-07-26 06:44:10 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל להשתמש בקריאות Nanopore כדי לסגור פערים או לפתור חזרות במכלול קריאה קצרה?
asked 2017-07-26 14:40:19 UTC
2
תשובות
כיצד להמיר באופן קבוע ויעיל תת קבוצה של באם ל- fastq?
asked 2017-07-26 16:54:47 UTC
2
תשובות
פורמולה לכיסוי k-mer
asked 2017-07-26 18:35:43 UTC
3
תשובות
האם ישנם מאגרי מידע זמינים לציבור המפרטים את מבנה החלבון ותחומים פונקציונליים?
asked 2017-07-26 20:20:57 UTC
2
תשובות
פורמט מזהה רצף קבוע?
asked 2017-07-26 22:21:23 UTC
1
תשובה
יצירת גרף של התפלגות פגיעות פיצוץ ברצף השאילתות
asked 2017-07-27 03:03:37 UTC
1
תשובה
האם בעת ביצוע ניתוח ביטוי דיפרנציאלי האם יש להסיר גנים עם ספירת קריאה נמוכה לפני הנורמליזציה או אחריה?
asked 2017-07-27 07:14:57 UTC
1
תשובה
כיצד מאפייני GFF3 (עמודה 9) משתנים מאלגוריתם של חיזוי גנים למשנהו
asked 2017-07-28 22:57:13 UTC
5
תשובות
כיצד אוכל לבצע ביעילות מסך מטגנום של "כל" המינים?
asked 2017-08-01 21:24:35 UTC
1
תשובה
יישור רצף מרובה עם R
asked 2017-08-03 13:54:49 UTC
1
תשובה
כיצד לחשב כיסוי ייחוס כולל עם MUMmer?
asked 2017-08-03 14:29:04 UTC
1
תשובה
FASTQC ייצג יתר על המידה רצפים לאחר זמירה
asked 2017-08-04 18:17:54 UTC
4
תשובות
מדוע לרצף את הגנום האנושי בכיסוי פי 30?
asked 2017-08-04 20:10:40 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל לערוך FASTQ ספציפי שנקרא במקום, בהתחשב במזהה הקריאה?
asked 2017-08-07 14:44:43 UTC
4
תשובות
כיצד להמיר מיטה ל- GFF3
asked 2017-08-08 14:59:08 UTC
2
תשובות
שונות משמעותית במהירות של BLAST בין חלבונים
asked 2017-08-10 04:26:20 UTC
2
תשובות
להמיס ערכי p עבור אתרי CpG הממופים לאותו גן
asked 2017-08-10 21:25:38 UTC
3
תשובות
כלים ליצירת טבלה מסומנת של גרסאות מ- VCF
asked 2017-08-11 03:44:41 UTC
1
תשובה
כלי או סקריפט לניתוח קבצי VCF עם הערות
asked 2017-08-11 12:44:08 UTC
3
תשובות
הסרת כפילויות PCR בניתוח RNA-seq
asked 2017-08-11 23:47:12 UTC
2
תשובות
מיפוי מרכזיות GRCh38
asked 2017-08-14 13:33:43 UTC
2
תשובות
ההבדל בין CPM ו- TPM ואיזה לניתוח במורד הזרם?
asked 2017-08-15 00:51:22 UTC
2
תשובות
כיצד להמיר fastq ל- fast5
asked 2017-08-15 15:46:21 UTC
1
תשובה
פצל FASTQ והתאמת BAM לחתיכות תואמות
asked 2017-08-17 07:33:01 UTC
2
תשובות
באיזה מדד יש להשתמש בנתוני PCA או RNA-seq? TPM או ספירות?
asked 2017-08-18 15:13:13 UTC
4
תשובות
כיצד לחלץ / להמיר רצפי CDS gff3 למולטיפסטה
asked 2017-08-21 14:45:34 UTC
2
תשובות
תקן אורך גנים או ספירת קריאה בניתוח העשרה GO
asked 2017-08-21 17:05:48 UTC
4
תשובות
הציגו שגיאות בתמלילי הפניה על פי מודל השגיאה החיצוני של מערך הנתונים
asked 2017-08-22 21:39:43 UTC
3
תשובות
האם יש דרך לאחזר כמה שדות SAM מהר יותר מאשר תצוגת samtools | לחתוך -f`?
asked 2017-08-23 01:51:08 UTC
2
תשובות
האם זה חכם להשתמש ב- RepeatMasker על פרוקריוטים?
asked 2017-08-24 18:42:57 UTC
2
תשובות
מהי קריאת אינדל ומה מטרתה?
asked 2017-08-25 02:07:59 UTC
3
תשובות
ניתוח RIP-seq?
asked 2017-08-25 02:26:20 UTC
2
תשובות
מזהה אנסמבל ל- GeneSymbol עם biomart
asked 2017-08-25 16:46:39 UTC
1
תשובה
באיזה פורמט זה? די בטוח שזה לא קובץ BED
asked 2017-08-29 21:31:13 UTC
1
תשובה
חילוץ נתוני ביטוי ממערך הנתונים של GSE שהורדו מ- GEO
asked 2017-08-30 12:15:16 UTC
1
תשובה
פרמטרים ארוכי כוכבים ליישור RNA ONT קורא לגנום
asked 2017-08-31 03:25:48 UTC
1
תשובה
בודק בקרות רצף ספייק-אין
asked 2017-08-31 12:41:10 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל למצוא מידע על צביעת גרם משם המין?
asked 2017-08-31 17:30:29 UTC
4
תשובות
שחזור אולטימטיבי ב- R?
asked 2017-08-31 19:06:02 UTC
1
תשובה
מה תהיה התפלגות מתמטית מתאימה לנתוני SNP?
asked 2017-09-01 07:55:20 UTC
1
תשובה
קרא וכתב קבצי FASTA עם יותר מידע מאשר מזהה ורצף
asked 2017-09-01 14:52:07 UTC
2
תשובות
שלב סינון לנתוני ספירת קריאה
asked 2017-09-01 17:03:46 UTC
1
תשובה
שימוש באלגוריתם t-SNE על נתוני מיקרו מערך + בונוס שגיאה
asked 2017-09-02 22:53:00 UTC
1
תשובה
כיצד לבנות קובץ כותרת BAM עם htslib ב- C ++?
asked 2017-09-04 12:54:45 UTC
1
תשובה
כיצד להתמודד עם SNP מתואם ב- GWAS?
asked 2017-09-05 12:59:59 UTC
3
תשובות
כיצד לקבוע את מספר ההצטרפות העיקרי של Uniprot מתוך קבוצה של מספרי הצטרפות?
asked 2017-09-06 00:09:50 UTC
1
תשובה
פירוש מציג גנומיקה אינטגרטיבית (IGV)
asked 2017-09-06 01:05:49 UTC
1
תשובה
היכן ניתן להוריד קובץ מיטת מוטיב של JASPAR TFBS?
asked 2017-09-06 02:44:42 UTC
2
תשובות
המרת מזהי גנים של אנסמבל לתעודות גנטיות של אנטרז באמצעות ביומארט
asked 2017-09-06 15:54:04 UTC
1
תשובה
כיצד לייצג מחיקה במיקום 1 בקובץ VCF?
asked 2017-09-06 18:59:05 UTC
2
תשובות
האם אנו יכולים לתאר נתוני רצף ביולוגי סינתטי כשייכים ל"מין "או" טקסון "?
asked 2017-09-07 11:26:43 UTC
1
תשובה
שרת למציאת קמרים בערכת רצפים
asked 2017-09-07 18:46:01 UTC
2
תשובות
הבהרה בנושא העשרת גנים
asked 2017-09-08 19:27:57 UTC
1
תשובה
ניתוח אסוציאציה SNP- פנוטיפ רק באמצעות SNPs על גן ספציפי
asked 2017-09-09 05:10:37 UTC
2
תשובות
האם ניתן לבצע יישור בתוך פייתון? בדוק וריאנטים לעומת הפניה?
asked 2017-09-14 03:46:00 UTC
1
תשובה
התמודדות עם היעדר כיסוי
asked 2017-09-14 14:24:27 UTC
2
תשובות
המלצת תוכנה: מצא התפלגות רצף DNA על פני תמליל שלם
asked 2017-09-15 20:33:14 UTC
1
תשובה
ביאור גנום חיידקי של זן מבודד קליני?
asked 2017-09-18 04:06:42 UTC
2
תשובות
דרך להשיג רצפים גנומיים בקואורדינטות נתונות מבלי להוריד תחילה קבצי fasta של כרומוזומים / גנומים שלמים?
asked 2017-09-20 07:22:25 UTC
1
תשובה
קובץ GTF hg38 עם הערות RefSeq
asked 2017-09-21 06:17:29 UTC
1
תשובה
האם בקבצי FASTA יכולים להיות רצפי נוקלאוטיד וחלבון; או שיש להם רק סוג אחד?
asked 2017-09-21 07:13:38 UTC
1
תשובה
מדוע פקודת makeblastdb זו אינה פועלת?
asked 2017-09-21 17:53:10 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל לחלץ שמות גנים למסלול מטבולי מ- KEGG?
asked 2017-09-24 16:14:22 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל לחשב את אורך הגן לחישוב RPKM מנתוני ספירות?
asked 2017-09-26 14:47:26 UTC
2
תשובות
* קבוצות קבוצות לא מאוזנות מאוד עבור DE
asked 2017-09-27 04:50:05 UTC
3
תשובות
כיצד לבדוק אם כל קריאת ה- BAM מכילות קבוצות קריאה מוגדרות?
asked 2017-10-02 01:20:35 UTC
2
תשובות
יישור רצף של ווטרמן-סמית-בייר
asked 2017-10-03 02:40:11 UTC
2
תשובות
כיצד למדוד או להקצות ערכי ציון הידרופוביות לחומצות אמינו בודדות במבנה PDB?
asked 2017-10-11 20:48:25 UTC
3
תשובות
לקרוא קבצי BAM ממוינים ואינדקסים מהר יותר ב- C ++?
asked 2017-10-13 04:24:58 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל להשיג רק את שם המינים עבור רצפי פאסטה מתוצאות הפיצוץ?
asked 2017-10-15 22:10:10 UTC
8
תשובות
כיצד להמיר קובץ fasta לקובץ מופרד בכרטיסייה
asked 2017-10-17 16:00:10 UTC
2
תשובות
האם יש מאגר של שכיחות מחלות?
asked 2017-10-19 16:01:20 UTC
3
תשובות
האם ניתן לאתר אקסונים מחוץ לרצף הקידוד?
asked 2017-10-20 12:29:16 UTC
2
תשובות
הרכבת הגנום מקריאות המועדות לטעות
asked 2017-10-22 17:20:58 UTC
3
תשובות
כיצד למפות רשתות PDB לתעודות מזהה של Uniprot באמצעות שירותי API
asked 2017-10-24 23:48:46 UTC
1
תשובה
האם picard מסמן שכפול מחליף את שכפול ה- PCR
asked 2017-10-27 19:49:30 UTC
3
תשובות
מהי רצף עמוק?
asked 2017-10-28 23:44:10 UTC
2
תשובות
ביטוי דיפרנציאלי עם 2 טיפולים
asked 2017-10-30 20:41:14 UTC
1
תשובה
חישוב כיסוי: קריאות ארוכות (RNA-seq)
asked 2017-10-31 13:15:38 UTC
1
תשובה
מהו פורמט רצף זה בן 5 עמודות משנת 2009?
asked 2017-10-31 19:58:24 UTC
3
תשובות
גידול סומטי היחיד שמתקשר?
asked 2017-11-01 04:30:46 UTC
2
תשובות
כיצד לשחרר חבילת R עם מספר קבצי מיטה?
asked 2017-11-03 05:33:45 UTC
2
תשובות
כיצד לפתור שגיאת נחש: "כללי היעד עשויים לא להכיל כרטיסי בר."
asked 2017-11-03 16:47:22 UTC
1
תשובה
איך אוכל לציין ל- DEseq2 לבצע רק השוואות איתן אני מעוניין?
asked 2017-11-04 17:37:07 UTC
2
תשובות
ביאור 5'UTR ו- 3'UTR בשמרים
asked 2017-11-06 17:28:31 UTC
2
תשובות
שגיאת BiomaRt: שגיאה ב- martCheck
asked 2017-11-07 12:14:04 UTC
2
תשובות
RapMap: תמליל הפניה לקריאות מדומות
asked 2017-11-09 03:37:19 UTC
6
תשובות
כיצד אוכל למצוא רצפים זהים בקובץ FASTA?
asked 2017-11-10 21:28:12 UTC
1
תשובה
מהי יישור מקומי ומה הבעיה שהיא פותרת?
asked 2017-11-11 01:37:20 UTC
3
תשובות
המרת VCF ל- FASTA נתנה הפניה עם Python, R.
asked 2017-11-12 16:27:38 UTC
1
תשובה
ודא חלבון צפוי בגנום אחד בגנום אחר מאותו המין
asked 2017-11-13 18:10:21 UTC
5
תשובות
מה קורה אם מתגלה באג גדול בחבילה ביואינפורמטית ששימשה בספרות שפורסמה?
asked 2017-11-14 06:26:36 UTC
1
תשובה
מדוע להיט BLAST חזק מאוד הולך לאיבוד כשאני משנה את הפרמטר num_alignments, num_deships או max_target_seqs?
asked 2017-11-14 21:21:32 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל לצבוע תיבות ב- Gviz AnnotationTrack ב- R?
asked 2017-11-15 15:43:17 UTC
3
תשובות
הכי פחות נוכחים K-mers בגנום האנושי
asked 2017-11-15 16:22:05 UTC
2
תשובות
כיצד לקבוע את מיקומו הסלולרי של החלבון על פי רצפו?
asked 2017-11-16 02:31:28 UTC
2
תשובות
כיצד נוצרים כפילויות של PCR ומדוע חשוב להסיר אותם לניתוח NGS?
asked 2017-11-16 22:55:21 UTC
4
תשובות
מדוע סך כל ה- RNA-seq בדרך כלל מניב קצב מיפוי נמוך?
asked 2017-11-21 16:54:44 UTC
2
תשובות
העברת תכונות גנומיות בקואורדינטות חדשות
asked 2017-11-22 16:43:48 UTC
2
תשובות
העריך את אורך זנבות הפולי-A מנתוני RNAseq שהוכנו באופן אקראי
asked 2017-11-24 03:21:47 UTC
2
תשובות
גנים כפולים עם ספירת RSEM: באיזה מהם לבחור?
asked 2017-11-30 16:09:02 UTC
2
תשובות
אסיפת קאנו אינה עושה קונצנזוס אחד?
asked 2017-12-03 02:35:38 UTC
1
תשובה
אודות ניסוי CAFA
asked 2017-12-05 01:41:59 UTC
1
תשובה
כיצד לקצץ רצפי מתאם מ- GSE65360 על מנת למפות את הקריאות?
asked 2017-12-06 04:35:12 UTC
2
תשובות
כיצד ניתן להשיג את כל הומולוגי ה- PDB מ- Uniprot (מיפוי + BLAST)?
asked 2017-12-12 19:33:06 UTC
1
תשובה
ספירת קריאות מקובץ BAM
asked 2017-12-14 15:41:43 UTC
7
תשובות
חישוב תדירות נוקלאוטיד לעמוד
asked 2017-12-14 22:40:01 UTC
3
תשובות
הראה נוכחות של מוטציה ידועה בנתוני RNA-seq
asked 2017-12-18 22:31:36 UTC
1
תשובה
כיצד לחשב את הסיכוי לאי גילוי גן בהתחשב במגבלת הזיהוי של פרוטוקול
asked 2017-12-19 06:24:43 UTC
3
תשובות
כיצד ניתן לציין את הסוף של בלוק הפלוטיפ ב- VCF?
asked 2017-12-19 16:32:48 UTC
1
תשובה
כיצד להסיר את כל קבוצות הקריאה של BAM מכל הקריאות (לא רק הכותרת)?
asked 2017-12-23 17:43:28 UTC
1
תשובה
קנה מידה על ידי רגרסיה לינארית כנגד מספר הקריאות
asked 2017-12-28 03:24:17 UTC
2
תשובות
מה הם כפילויות בנתונים בודדים של RNA-seq?
asked 2017-12-28 04:13:33 UTC
2
תשובות
ליס בביואינפורמטיקה
asked 2017-12-29 00:02:57 UTC
3
תשובות
להסיק תכונות UTR חסרות בקובץ GFF3
asked 2017-12-29 23:49:41 UTC
2
תשובות
ההבדל בין שיטות הרכבת התעתיק דה נובו
asked 2018-01-03 21:25:19 UTC
1
תשובה
סדר הסרת השפעות אצווה, זקיפת נתונים ונורמליזציה של גודל הספרייה בנתוני scRNA-seq
asked 2018-01-04 02:22:15 UTC
2
תשובות
קביעת כפילות ב- RNA-seq תא בודד
asked 2018-01-04 05:55:57 UTC
1
תשובה
מדוע Biopython AlignIO.read () אינו מזהה את הפורמט 'סגול'?
asked 2018-01-04 17:40:13 UTC
1
תשובה
חסרונות של נורמליזציה של הרבעון העליון לנתוני scRNA-seq
asked 2018-01-06 03:59:49 UTC
3
תשובות
שפר את מערך הנתונים של scRNA-seq לניתוח נוסף
asked 2018-01-06 06:10:02 UTC
2
תשובות
הקצה סוגי תאים לקבוצות תאים על סמך פרופילי ביטוי הגנים שלהם
asked 2018-01-09 04:36:13 UTC
2
תשובות
האם זהו אזור מורכבות נמוך בגנום האנושי שלנו?
asked 2018-01-09 12:36:32 UTC
1
תשובה
בדיקת אתניות מקבצי bam או vcf
asked 2018-01-09 15:41:36 UTC
2
תשובות
האם שבר MAPQ = 0 מקובץ BAM תלוי בגדלי ההוספה?
asked 2018-01-09 15:56:39 UTC
3
תשובות
כיצד אוכל לספור את מספר הקריאות התומכות בגרסה בקובץ bam?
asked 2018-01-15 16:13:52 UTC
2
תשובות
האם גנים מיטוכונדריאליים אינם נכללים ב- scRNA-seq כגון גנים ריבוזומליים?
asked 2018-01-20 03:49:02 UTC
2
תשובות
פיתוח חבילות R: כיצד מתקינים אוטומטית חבילות Bioconductor עם התקנת החבילה?
asked 2018-01-22 23:01:06 UTC
6
תשובות
כיצד לקבוע משנה של BAM לפי רשימת QNAME?
asked 2018-01-24 00:41:27 UTC
1
תשובה
להיטי פיצוץ נעלמים לאחר שינוי -ערך
asked 2018-01-26 19:51:34 UTC
1
תשובה
מהן יחידות הספירה ב- DEseq2?
asked 2018-01-27 03:53:09 UTC
2
תשובות
כלים לעשות המרה VCF ל- MAF ו- MAF ל- VCF?
asked 2018-01-28 04:01:25 UTC
2
תשובות
האם יש דרך סטנדרטית לנקות קובץ PDB ולמנות מחדש את שאריותיו?
asked 2018-02-01 23:05:44 UTC
1
תשובה
SNP הממוקם באזור היזם (חזיר)
asked 2018-02-02 06:13:23 UTC
1
תשובה
כיצד דלפקי הקמר קובעים איזה קמר הוא 'קנוני'?
asked 2018-02-04 22:24:36 UTC
3
תשובות
כיצד להגדיר דוגמאות משנה מקובץ VCF?
asked 2018-02-07 06:39:45 UTC
2
תשובות
כיצד לכתוב פונקציית חשיש לקמרים קנוניים?
asked 2018-02-08 06:06:19 UTC
6
תשובות
קובץ מיטה עם N אזורים של התייחסות GRCh38?
asked 2018-02-13 15:45:05 UTC
1
תשובה
אטלס תאים אנושיים - זמינות נתונים
asked 2018-02-14 17:16:36 UTC
3
תשובות
מדוע שימוש בקריאות רבות יותר יכול להוביל להרכבה באיכות נמוכה יותר?
asked 2018-02-16 01:10:58 UTC
5
תשובות
קבוצת משנה BAM קטנה יותר שתכיל כמה אלפי שורות מכרומוזומים מרובים
asked 2018-02-17 18:00:18 UTC
2
תשובות
הטיה של 5 'ו -3' בנתוני Rna-seq
asked 2018-02-18 16:36:18 UTC
7
תשובות
מהי הדרך המהירה ביותר להשיג השלמה הפוכה של רצף DNA בפיתון?
asked 2018-02-20 11:10:43 UTC
1
תשובה
כיצד להכין מפות צבע כרומוזומים לטווחי המיטה
asked 2018-02-21 17:05:08 UTC
2
תשובות
האם אוכל להשתמש במחשב שלי כאשר MinION עובר רצף מבלי להשפיע לרעה על הריצה?
asked 2018-02-21 22:29:22 UTC
3
תשובות
כיצד לחשב את השימוש בזיכרון באחסון קמרים ב- RAM
asked 2018-02-23 11:09:26 UTC
1
תשובה
מדוע שמישהו ישתמש ב- CRAM במקום ב- BAM?
asked 2018-02-26 06:16:32 UTC
3
תשובות
מדוע cutadapt מסיר בסיסים באיכות נמוכה מקצוות הקריאות בלבד?
asked 2018-02-26 18:07:33 UTC
1
תשובה
סיווג (למידה מפוקחת) של נתוני ביטוי ברמת המסלול
asked 2018-02-27 16:31:08 UTC
1
תשובה
האם ניתן להמיר קובץ נתונים בפורמט VCF לפאסטה?
asked 2018-02-27 21:01:29 UTC
2
תשובות
המרת קובץ VCF לקבצי PLINK bed / bim / fam
asked 2018-03-01 00:55:00 UTC
3
תשובות
יצירת היישור המשוחזר מ- BAM
asked 2018-03-01 10:07:12 UTC
1
תשובה
האם ניתן להשתמש בקריאות קצה זוגיות עם הטרוזיגוזיות גבוהה כדי ללטש את הרכבת PacBio?
asked 2018-03-02 08:29:07 UTC
1
תשובה
האם ה- DNA או ה- RNA של קבוצות אתניות מסוימות ממפים טוב יותר מאחרים את רצף הגנום של הייחוס האנושי?
asked 2018-03-04 06:43:01 UTC
2
תשובות
פרוטוקולי הכנת ספרייה תקועים לעומת לא ממותגים ב- RNAseq
asked 2018-03-07 09:57:10 UTC
1
תשובה
מחלצים את מחרוזת CIGAR מ- BAM דרך Python?
asked 2018-03-10 00:09:08 UTC
1
תשובה
הסבר אינטואיטיבי לניתוח GSVA
asked 2018-03-11 02:33:00 UTC
2
תשובות
המר קובץ BAM ל- BAM הניתן לדחיסה גבוהה
asked 2018-03-12 11:02:21 UTC
1
תשובה
תפוקת סלמון: תמלילי כימות עם אפס קריאת תמיכה
asked 2018-03-12 18:51:54 UTC
1
תשובה
כיצד לחשב ביעילות את האחוז המדויק של k-mers שאינם ייחודיים בגנום עבור k נתון?
asked 2018-03-14 13:44:03 UTC
1
תשובה
ספירת רצפי קמרים חוזרים ונשנים התואמים לפחות x% מרצף הקריאות
asked 2018-03-14 16:45:08 UTC
1
תשובה
הפעל gffread במצב רב תבריג
asked 2018-03-14 19:21:09 UTC
1
תשובה
כיצד מסומנים מיקומים חזותית בדפדפן הגנום UCSC?
asked 2018-03-17 17:54:41 UTC
1
תשובה
חילוץ קווצות ספציפיות קורא מפרוטוקול MinION cDNA-PCR
asked 2018-03-20 05:26:57 UTC
4
תשובות
מיזוג אזורים על פי המזהה שלהם
asked 2018-03-20 14:03:00 UTC
5
תשובות
הסר / מחק רצפים לפי מזהה ממולטיפסטה
asked 2018-03-20 23:08:44 UTC
1
תשובה
האם ישנן שיטות / כלים יישור מסוימים המניבים ביצועים טובים יותר עם צפיפות גבוהה של אינדלים?
asked 2018-03-20 23:53:31 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל לקבל בקלות את התפלגות גודל הקריאה של מיפוי קריאות על קבוצה מסוימת של אזורים?
asked 2018-03-21 20:22:24 UTC
3
תשובות
המרת אובייקט נתונים R RNA-seq לאובייקט פייתון
asked 2018-03-21 21:27:53 UTC
3
תשובות
ספרים על אלגוריתמי ביואינפורמטיקה
asked 2018-03-27 17:48:10 UTC
3
תשובות
כלי טוב להדמיה של לוקוס גנים
asked 2018-03-28 01:02:19 UTC
2
תשובות
כיצד htslib / samtools ניגש לשדות BAM אופציונליים?
asked 2018-04-03 08:49:40 UTC
3
תשובות
כיצד לזהות חתימות ביטוי גנים מנתוני ביטוי גנים?
asked 2018-04-04 13:45:54 UTC
2
תשובות
האם יש חבילת Python / R עם יכולת להמיר יישור והפניה ל CIGAR?
asked 2018-04-04 22:05:03 UTC
1
תשובה
מהו אתר להחלפת תבניות?
asked 2018-04-07 00:07:18 UTC
2
תשובות
המרת קובץ BAM ל- VCF
asked 2018-04-07 23:03:32 UTC
3
תשובות
חלקת הר געש בר '
asked 2018-04-18 13:45:47 UTC
2
תשובות
במה שונים ניתוחי רכיבים עיקריים וניתוחי תערובת ממערך גנטי?
asked 2018-04-19 08:32:18 UTC
2
תשובות
מדוע לבחור ב- CNN למתקשר משתנה
asked 2018-04-19 19:21:39 UTC
3
תשובות
ויזואליזציה של יישור הגנום
asked 2018-04-25 13:34:18 UTC
1
תשובה
למזג 2 רכיבי VCF ממתקשרים שונים
asked 2018-04-27 19:58:12 UTC
3
תשובות
האם יש דרך יעילה לבדוק BAM קלט ב- R?
asked 2018-05-01 22:04:54 UTC
1
תשובה
FeaturePlot מ- Seurat: שנה את הכותרת שלה
asked 2018-05-02 03:02:06 UTC
1
תשובה
התנהגות דגל '- הפניה' עם מיון samtools
asked 2018-05-03 03:25:33 UTC
2
תשובות
קריאות ממופות לאזורים אקסוניים, אינטרוניים ואינטרגניים
asked 2018-05-07 20:49:42 UTC
2
תשובות
הגדר ידנית אשכולות בסאורה וקבע גנים של סמן
asked 2018-05-08 03:20:07 UTC
1
תשובה
כיצד לאמת שהורידו כראוי את ה- BAM?
asked 2018-05-09 02:03:46 UTC
1
תשובה
אילו מקרים משתמשים בשיטות ה- DE בסאוראט
asked 2018-05-11 05:30:22 UTC
2
תשובות
מספר רצפי ההתייחסות בקובץ SAM
asked 2018-05-14 19:40:08 UTC
3
תשובות
פרמטר רזולוציה בתפקוד FindClusters של Seurat למספרי תאים גדולים יותר
asked 2018-05-14 23:10:30 UTC
2
תשובות
האם יש הגדרה סטנדרטית ל"ליטוש הרכבה "?
asked 2018-05-16 00:19:22 UTC
1
תשובה
עץ פילוגנטי Biopython להחליף תוויות קצה ענף על ידי סמלי רצף
asked 2018-05-21 17:41:02 UTC
4
תשובות
ניתוח רמת מסלול של ביטוי גנים תא יחיד
asked 2018-05-23 21:03:02 UTC
2
תשובות
גודל הקבוצה הקטן ביותר לביטוי דיפרנציאלי בלימה (RNA-Seq בתפזורת)
asked 2018-05-24 19:30:03 UTC
2
תשובות
מדוע יחס טי / טלוויזיה?
asked 2018-05-25 17:55:04 UTC
1
תשובה
מדוע לא ניתן ליישר קו יישור ציבורי תחת מחיקת חלק מהרצפים?
asked 2018-05-27 19:40:57 UTC
1
תשובה
השוואת רשת של תאים בודדים (מנתוני רצף)
asked 2018-05-29 18:50:53 UTC
1
תשובה
שיחות שיא של Macs2?
asked 2018-06-07 21:33:25 UTC
2
תשובות
מהו "שבר הפעלת פולימראז אפשרי"?
asked 2018-06-10 06:23:30 UTC
2
תשובות
מתאם Spearman עבור מערך נתונים גדול
asked 2018-06-16 15:53:37 UTC
1
תשובה
יישור טוב יותר מאשר bowtie2?
asked 2018-06-18 02:27:46 UTC
2
תשובות
צמצם את מספר התמלילים במכלול תעתיק דה נובו משתנה מאוד
asked 2018-06-28 21:18:36 UTC
2
תשובות
ההבדל בין samtools לסמן כפילויות לבין samtools להסיר כפילויות?
asked 2018-07-03 14:49:43 UTC
2
תשובות
לא נמצא גרסה המשתמשת ב- GATK 4.0 HaplotypeCaller
asked 2018-07-04 00:49:04 UTC
3
תשובות
מתכננים שני מפות חום באותו סדר גנים
asked 2018-07-04 20:23:37 UTC
1
תשובה
הדרך הפשוטה ביותר לעבוד על סוג גרסה מבנית?
asked 2018-07-16 17:57:37 UTC
2
תשובות
הערכת גודל הגנום: גישה מבוססת kmer מ- PacBio קוראת
asked 2018-07-23 12:19:13 UTC
2
תשובות
החלטה אילו דגימות עוברות באיזו אצווה
asked 2018-07-24 19:29:33 UTC
1
תשובה
האם צריך לתקן PCA לביטוי גנים?
asked 2018-07-30 23:47:52 UTC
1
תשובה
שימוש ב pysam עם cython: htslib / kstring.h לא נמצא
asked 2018-08-02 22:36:47 UTC
2
תשובות
האם שמות גנים זהים בין מינים?
asked 2018-08-05 06:24:07 UTC
3
תשובות
דגימת הפלוטיפים
asked 2018-08-08 15:01:07 UTC
1
תשובה
באיזה שלב של מכלול התמלול עדיף לבצע פילטר מזהם קריאה?
asked 2018-08-21 19:18:19 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל לבדוק את השערותיי מבחינה חישובית
asked 2018-08-22 21:31:53 UTC
2
תשובות
האם אלה קיצורי מינים סטנדרטיים וכיצד לחפש אחרים?
asked 2018-08-24 23:00:34 UTC
2
תשובות
ספירת אותיות בעמודות יישור פיליפ עם ביופיתון
asked 2018-08-29 11:35:54 UTC
1
תשובה
השגת כל עצי ה- NNI של עץ פרזוני
asked 2018-08-31 02:24:07 UTC
2
תשובות
הפעלת SnakeMake באשכול
asked 2018-09-05 06:16:19 UTC
2
תשובות
יישור רצפים באמצעות מודל מרקוב
asked 2018-09-11 13:30:16 UTC
2
תשובות
מהי הדרך הנכונה למפות נתוני Hi-C באמצעות bwa mem?
asked 2018-09-22 03:14:44 UTC
1
תשובה
תיעוד GATK לעומק הנדרש כדי לקרוא באופן אמין למוטציה הטרוזיגוטית באורגניזם דיפלואידי?
asked 2018-09-24 21:02:33 UTC
2
תשובות
כיצד מגדירים אוכלוסיית אנשים אוכלוסיה?
asked 2018-09-25 19:18:48 UTC
1
תשובה
מהו וכיצד לזהות קריאה מודגשת
asked 2018-09-27 03:12:47 UTC
2
תשובות
כיצד להשיג תוצאות פיצוץ על פי הפרשנות האינטואיטיבית של '-מקס_מטרות_שייכות'?
asked 2018-09-28 14:54:17 UTC
3
תשובות
אובייקטים הממוזגים של סורת tSNE - כיצד לצייר על תעודות זהות מקוריות?
asked 2018-10-02 20:34:44 UTC
1
תשובה
חילוץ רצפים מ- FASTA החל מסוף 5 'משותף
asked 2018-10-04 01:13:49 UTC
2
תשובות
טווחי קואורדינטות של תמלול לקואורדינטות גנומיות
asked 2018-10-05 09:23:03 UTC
3
תשובות
מהו קובץ fastq האינדקס (sample_I * .fastq.gz) שנוצר בעת ריבוי ריבוי זוגי של Illumina?
asked 2018-10-09 00:20:26 UTC
3
תשובות
מציאת כותרות ייחודיות בקובץ fasta באמצעות שורת הפקודה linux
asked 2018-10-10 07:32:40 UTC
3
תשובות
סקריפט כדי לאפשר ניתוח העשרה של ערכת גנים של נתוני גנומיקה פי 10 ב- R.
asked 2018-10-17 23:46:08 UTC
1
תשובה
מה הם "קריאות מפוצלות" ו"אשכולות אינטרון? "
asked 2018-10-19 00:15:30 UTC
2
תשובות
כיצד לדמות קריאות ננו-פוריות?
asked 2018-10-23 12:40:11 UTC
3
תשובות
סקריפטים של Bash FastQC למספר קבצי fastq במספר ספריות
asked 2018-10-26 14:55:25 UTC
3
תשובות
סינון מהיר של מרווחים שלא נופלים במרחק מסוים מגנים ידועים
asked 2018-10-28 05:02:56 UTC
5
תשובות
מחק את כל 4 השורות של fastq שנקרא מקובץ fastq באמצעות מזהה קריאה
asked 2018-10-30 14:01:57 UTC
3
תשובות
סה"כ קריאות מיישרות לכל הפניה בתוך קובץ bam
asked 2018-10-30 19:35:56 UTC
4
תשובות
ספירה כפולה של זוגות קריאה חופפים
asked 2018-11-13 05:26:41 UTC
2
תשובות
קורא SNVs דיפלואידי מ קריאות ארוכות
asked 2018-11-22 16:58:02 UTC
2
תשובות
הדמיה מלאה של יישור הגנום בטיוטה
asked 2018-11-22 21:02:06 UTC
1
תשובה
האם הקובץ ".full.aln" המיוצר על ידי snippy-core מכיל את כל הבסיסים של רצפי הקלט שלי מיושרים לגנום הייחוס?
asked 2018-11-25 01:17:09 UTC
4
תשובות
מהו כלי שורת פקודה פשוט לביצוע יישור זוגי של Needleman-Wunsch בשורת הפקודה
asked 2018-11-26 19:58:03 UTC
2
תשובות
מהי הצלת בן זוג בבוו מם?
asked 2018-11-27 00:23:51 UTC
3
תשובות
bcftools המסנן את כל הקבצים בספריה
asked 2018-12-01 05:03:51 UTC
2
תשובות
מה הפירוש של ערך FDR של 1 ב- RNA-seq?
asked 2018-12-01 07:50:21 UTC
1
תשובה
שגיאת סקריפט Bash בפקודה הדבק
asked 2018-12-04 16:08:26 UTC
1
תשובה
כיצד להפיק את כל הרצפים עם bwa mem, לא "*"?
asked 2018-12-04 20:40:04 UTC
1
תשובה
הבנת האתחול של האלגוריתם Needleman-Wunsch
asked 2018-12-06 08:18:14 UTC
3
תשובות
ייבוא ​​קובץ GFF עם ביופיתון
asked 2018-12-10 08:19:10 UTC
1
תשובה
הפיקו GTF המכיל גנים המקודדים חלבונים מקובץ GTF עם Exons ו- CDS
asked 2018-12-10 17:48:42 UTC
1
תשובה
כיצד למצוא את כל ה- Seqs באורך משתנה עם התאמה מדויקת של 5 'ו -3' בקובץ FASTA
asked 2018-12-11 01:37:16 UTC
1
תשובה
מדוע אורך קריאה של PacBio גדול יותר מאזור הייחוס המיושר?
asked 2018-12-13 05:33:21 UTC
6
תשובות
זיהוי אינדלים מכרומטוגרמות
asked 2018-12-16 14:00:15 UTC
2
תשובות
שליטת רוחב של samtools tview "תמונת מצב" בעת הפניה מחדש
asked 2018-12-20 21:25:59 UTC
1
תשובה
מדוע לקובץ ה- bam האנושי הזה יש רק עותק אחד של כל כרומוזום?
asked 2018-12-24 11:15:53 UTC
1
תשובה
האם פרוקה עושה תרגומים עם שש מסגרות?
asked 2018-12-28 01:01:37 UTC
1
תשובה
כיצד לנרמל את נתוני scRNASeq לניתוח ביטוי דיפרנציאלי
asked 2018-12-28 11:03:49 UTC
1
תשובה
מיפוי קריאה הטרוזיגטי מאוד
asked 2019-01-11 03:18:05 UTC
1
תשובה
SNP לעומת מוטציה נקודתית
asked 2019-01-15 10:35:14 UTC
1
תשובה
Albacore basecalling פועל אך פלט 0 קריאות
asked 2019-01-23 02:26:15 UTC
2
תשובות
כיצד לבדוק אם אינדלים בקובצי VCF מיושרים שמאלה או ימינה?
asked 2019-01-23 10:56:09 UTC
2
תשובות
כיצד להתקשר נכון לקובץ VCF באמצעות DNA פגום? (IonTorrent ו- FFPE)
asked 2019-01-31 00:34:49 UTC
3
תשובות
מדוע Illumina אם PacBio מספק קריאות ארוכות וטובות יותר?
asked 2019-01-31 11:39:46 UTC
3
תשובות
הפעלת נחש נחש בשכונת יחיד אחת
asked 2019-01-31 21:17:35 UTC
2
תשובות
חשב את האחוז של כל עץ פילוגנטי ייחודי בפלט BEAST
asked 2019-02-05 16:33:38 UTC
2
תשובות
קבלת הרישיונות של כל החבילות המותקנות בתנאי conda
asked 2019-02-12 13:31:10 UTC
3
תשובות
אקראיות ב- BLAST
asked 2019-02-15 03:47:37 UTC
1
תשובה
שאלות בנוגע לניתוח רצף של ננופור
asked 2019-02-15 04:24:29 UTC
3
תשובות
כיצד להשיג קובץ יישור מהיר מקובץ SAM / BAM?
asked 2019-02-17 16:38:50 UTC
4
תשובות
זהה אזורים שאינם מקודדים מתוך הערת גנום
asked 2019-02-22 18:20:35 UTC
2
תשובות
כיצד אוכל להסיר כפילויות (לא טריוויאליות) מקובץ VCF?
asked 2019-02-27 21:56:46 UTC
1
תשובה
כלי חיפוש לחישוב שיעור שגיאות שלב / מתג
asked 2019-03-13 02:53:51 UTC
2
תשובות
הגדרת "זרע" ביישור הרצף
asked 2019-03-16 08:22:52 UTC
1
תשובה
מה ההבדל בין צינור ביואינפורמטיקה לזרימת עבודה?
asked 2019-03-28 21:50:49 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל לבקש מעשה נחש לייצר דאג בו כל צומת מייצג כלל?
asked 2019-04-08 03:35:04 UTC
2
תשובות
האם אלגוריתמי בניית עצים פילוגנטיים שונים מאלגוריתמי אשכולות כלליים?
asked 2019-04-09 10:15:37 UTC
1
תשובה
האם יש דרך להרכיב תחרויות החל מרצף ספציפי?
asked 2019-04-09 16:50:23 UTC
2
תשובות
מה הפירוש של "אחזור לפי אזור אינו זמין עבור קבצי SAM"?
asked 2019-04-10 20:51:29 UTC
2
תשובות
מהי דרך מהירה למצוא את ההשלמה ההפוכה בבאש
asked 2019-04-15 14:46:13 UTC
1
תשובה
מדוע תוצאות הקליסטו והסלמון שלי שונות כל כך רק בתמלילי lncRNA?
asked 2019-04-23 21:20:36 UTC
1
תשובה
כיצד אוכל לתרגם אינפיקס למתמ"ל באמצעות ממשק הפיתון ל libsbml?
asked 2019-07-18 13:58:35 UTC
1
תשובה
שאלת נוסחת עיצוב
asked 2019-08-05 20:47:55 UTC
2
תשובות
מדלג על קריאה
asked 2019-08-22 05:51:18 UTC
2
תשובות
מה זה 'k' ברצף?
asked 2019-12-28 07:30:35 UTC
4
תשובות
מדוע הגנום של נגיף העטרה SARS-Cov2 מסתיים באאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאאא (33 א ')?
asked 2020-01-25 06:55:20 UTC
3
תשובות
מאמר חדש מציע כי לנגיף הקורונה יש "דמיון מוזר של תוספות ייחודיות בחלבון הספייק של 2019-nCoV ל- HIV-1" - מה זה אומר?
asked 2020-02-01 02:37:12 UTC
1
תשובה
האם יתכן שוירוס הקורונה או ה- SARS יהיו סינתטיים?
asked 2020-02-04 07:54:07 UTC
2
תשובות
האם תוכנת קוד פתוח יכולה להיבדק ולפרסם?
asked 2020-02-05 07:48:39 UTC
5
תשובות
מדוע רצף ה- FASTA לנגיף העטרה נראה כמו DNA, ולא RNA?
asked 2020-02-09 23:13:16 UTC
2
תשובות
מאמר כלכלן בנושא וירוס כורונה
asked 2020-03-02 20:47:36 UTC
1
תשובה
מבני RNA של קורונאווירוס?
asked 2020-03-08 02:51:13 UTC
8
תשובות
מכיוון שלכל אדם יש DNA שונה (שילובים שונים של C, G, A, T) מה המשמעות של ביצוע הגנום?
asked 2020-03-24 19:41:29 UTC
2
תשובות
הבנת חלק מצווארי הבקבוק החישוביים של מחקר Covid-19
asked 2020-03-30 23:06:09 UTC
1
תשובה
Biohackers Netflix - DNA לבינארי ווידאו
asked 2020-08-21 04:38:04 UTC
Loading...